Tokarczuk sinh ở Sulechów gần Zielona Góra, Ba Lan. Trước khi nổi tiếng với sự nghiệp văn chương, từ năm 1980, bà đã theo học ngành tâm lý học tại Đại học Warsaw. Trong thời gian sinh viên, bà đã làm tình nguyện viên cho một viện tâm thần cho thanh thiếu niên có các vấn đề về hành vi.[9] Sau khi tốt nghiệp năm 1985, ban đầu bà đến Wrocław và sau đó đến Wałbrzych, nơi bà bắt đầu hành nghề trị liệu. Tokarczuk tự coi mình là học trò của Carl Jung và trích dẫn tâm lý học của mình như một nguồn cảm hứng cho tác phẩm văn học của mình. Từ năm 1998, Tokarczuk đã sống trong một ngôi làng nhỏ gần Nowa Ruda, nơi bà cũng quản lý công ty xuất bản riêng của mình Ruta. Bà là thành viên của Đảng Xanh (Ba Lan), một đảng chính trị.[10]